Здравствуйте!
Организация, арендующая автомобиль у физлица, является налоговым агентом, обязана удерживать из арендной платы НДФЛ, перечислять в бюджет и включать в отчетность суммы арендной платы.
Цитата:В договоре было оговорено, что физ.лицо само оплачивает НДФЛ. Работник сам подает 3 НДФЛ. Значит получается не надо было? (т.к. я не показывала его в справке 2-ндфл)
Если пункт договора противоречит Закону, то исполняется Закон. Пункт договора не может отменить нормы НК. ФНС последует этому принципу, и будет права. Иначе все мы много чего в договорах нафантазировали бы.
Когда ФНС начнет разбираться с декларацией, то увидит противоречие со сданной Вами отчетностью. В частности, Вы не отразили доходы физлица в справке 2-НДФЛ. Запросят организацию, не отразившую доходы и не удержавшую НДФЛ. Последуют штрафные санкции.
Один из вариантов выхода из этой ситуации: договориться с физлицом, чтобы внес НДФЛ в кассу, НДФЛ срочно заплатить в бюджет с пенями, подать уточненку по 2-НДФЛ, где указать арендную плату, исчисленный и удержанный НДФЛ, заменить 2-НДФЛ у физлица.